توماس جفرسون هنگام برگزاری مجمع فیلادلفیا سفیر آمریکا در فرانسه بود و در نشستهای مجمع حضور نداشت ولی از طریق جیمز مدیسون، دوست نزدیکاش، در جریان آنچه میگذشت قرار میگرفت. او در نامهای خطاب به مدیسون نظرش را درباره متن نهایی پیشنهادی قانون اساسی بیان کرد.
جفرسون تشکیل دولت متکی به خود و تفکیک قوا را میپسندد، اما میگوید مجلس نمایندگان در برخی حوزهها مثل سیاست خارجی، صلاحیت قانونگذاری ندارد. نیز تاکید میکند فقط نمایندگانی که مستقیما از سوی مردم انتخاب شوند، حق وضع مالیاتها را دارند. او این را یک «اصل اساسی» و مقدم بر همه ملاحظات دیگر میدانست.
جفرسون همچنین مخالفتهایی با متن پیشنهادی داشت. از جمله بر لزوم اضافهشدن یک منشور حقوق شهروندی به قانون اساسی تاکید میکرد و باور داشت این منشور حق مسلم مردم و حافظ حقوق آنها در مقابل هر دولتی – مرکزی یا محلی – در هر کجای دنیا ست. این ایراد در اولین نشست کنگره با الحاق ده اصلاحیه به قانون اساسی رفع شد.
